Lembaga Pelayanan yang bergabung di dalam JKLPK disebut sebagai Partisipan. Terdiri dari berbagai kategori pelayanan seperti : Unit Diakonia Gereja, Lembaga Swadaya dan Prakarsa Masyarakat, Lembaga Pendidikan, Lembaga Kesejahteraan Sosial seperti Panti Sosial, Lembaga Rehabilitasi, Lembaga Pendidikan dan Pekerja Sosial, Lembaga Peneliti dan Perubahan Sosial. 

Hingga KONAS XII, JKLPK mempunyai 263 partisipan tersebar di seluruh wilayah Indonesia yang terbagi dalam 12 region

Prosedur Permohonan menjadi Partisipan menjadi partisipan JKLPK:

1. Membuat surat permohonan untuk diterima menjadi partisioan JKLPK

2. Menyetujui Visi dan Misi JKLPK 

3. Mengirimkan fotocopy Akte Pendirian Lembaga

4. Mengisi formulir (profil) lembaga Calon partisipan 

5. Meminta Surat Rekomendasi dari tiga (3) partisipan yang telah menjadi partisipan JKLPK di regional masing-masing atau sinode/gereja, jika lembaga di bawah lembaga gereja. Direkomendasikan kordinator/ketua Region di daerah dimana calon partsipan.

6. Mengirim dua (2) foto kegiatan yang menggambarkan aktivitas lembaga

Setelah semua syarat dipenuhi, maka lembaga tersebut menjadi partisipan JKLPK yang diputuskan dan di sahkan dalam KONSULTASI NASIONAL (KONAS) yang dilaksanakan sekali dalam 3 tahun.